Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO2P61956 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SUMO2P61956 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SUMO2P61956 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SUMO2P61956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUMO2P61956 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO2P61956 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms