Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01547P58512 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01547P58512 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01547P58512 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01547P58512 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms