Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB25P57735 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB25P57735 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB25P57735 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB25P57735 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB25P57735 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB25P57735 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB25P57735 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB25P57735 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB25P57735 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB25P57735 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB25P57735 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB25P57735 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB25P57735 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB25P57735 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB25P57735 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB25P57735 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB25P57735 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB25P57735 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB25P57735 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB25P57735 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB25P57735 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB25P57735 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB25P57735 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB25P57735 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB25P57735 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB25P57735 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB25P57735 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB25P57735 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB25P57735 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB25P57735 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB25P57735 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB25P57735 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB25P57735 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB25P57735 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB25P57735 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB25P57735 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB25P57735 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB25P57735 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB25P57735 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB25P57735 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB25P57735 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB25P57735 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB25P57735 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB25P57735 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB25P57735 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB25P57735 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB25P57735 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB25P57735 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB25P57735 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB25P57735 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB25P57735 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB25P57735 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB25P57735 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB25P57735 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB25P57735 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB25P57735 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB25P57735 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB25P57735 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB25P57735 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB25P57735 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB25P57735 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB25P57735 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB25P57735 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB25P57735 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB25P57735 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB25P57735 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB25P57735 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB25P57735 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB25P57735 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB25P57735 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB25P57735 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB25P57735 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB25P57735 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB25P57735 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB25P57735 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB25P57735 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB25P57735 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB25P57735 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB25P57735 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB25P57735 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB25P57735 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB25P57735 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB25P57735 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB25P57735 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB25P57735 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB25P57735 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB25P57735 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB25P57735 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB25P57735 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB25P57735 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB25P57735 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB25P57735 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB25P57735 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB25P57735 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB25P57735 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB25P57735 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB25P57735 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB25P57735 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB25P57735 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms