Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23AP54725 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23AP54725 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23AP54725 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23AP54725 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23AP54725 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23AP54725 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23AP54725 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23AP54725 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD23AP54725 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23AP54725 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23AP54725 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD23AP54725 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms