Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP5CP53041 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP5CP53041 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP5CP53041 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP5CP53041 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP5CP53041 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP5CP53041 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms