Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.38■■■■■ 5.66
SMARCA4P51532 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC50.37■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC50.34■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC50.32■■■■■ 5.65
SMARCA4P51532 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
SMARCA4P51532 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC50.28■■■■■ 5.64
SMARCA4P51532 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.64
SMARCA4P51532 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.64
SMARCA4P51532 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC50.25■■■■■ 5.64
SMARCA4P51532 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
SMARCA4P51532 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC50.24■■■■■ 5.63
SMARCA4P51532 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.23■■■■■ 5.63
SMARCA4P51532 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
SMARCA4P51532 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
SMARCA4P51532 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
SMARCA4P51532 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.17■■■■■ 5.62
SMARCA4P51532 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
SMARCA4P51532 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
SMARCA4P51532 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
SMARCA4P51532 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC50.1■■■■■ 5.61
SMARCA4P51532 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
SMARCA4P51532 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
SMARCA4P51532 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC50.07■■■■■ 5.61
SMARCA4P51532 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC50.05■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.05■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC50.02■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC50.01■■■■■ 5.6
SMARCA4P51532 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC50■■■■■ 5.59
SMARCA4P51532 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC49.98■■■■■ 5.59
SMARCA4P51532 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
SMARCA4P51532 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
SMARCA4P51532 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC49.95■■■■■ 5.59
SMARCA4P51532 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
SMARCA4P51532 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
SMARCA4P51532 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
SMARCA4P51532 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
SMARCA4P51532 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
SMARCA4P51532 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
SMARCA4P51532 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
SMARCA4P51532 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
SMARCA4P51532 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC49.85■■■■■ 5.57
SMARCA4P51532 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
SMARCA4P51532 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
SMARCA4P51532 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
SMARCA4P51532 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
SMARCA4P51532 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
SMARCA4P51532 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
SMARCA4P51532 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
SMARCA4P51532 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC49.76■■■■■ 5.56
SMARCA4P51532 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC49.74■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC49.71■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC49.69■■■■■ 5.55
SMARCA4P51532 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
SMARCA4P51532 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
SMARCA4P51532 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC49.66■■■■■ 5.54
SMARCA4P51532 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
SMARCA4P51532 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
SMARCA4P51532 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC49.61■■■■■ 5.53
SMARCA4P51532 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC49.58■■■■■ 5.53
SMARCA4P51532 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC49.55■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC49.54■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
SMARCA4P51532 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC49.46■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC49.46■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.45■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC49.45■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC49.45■■■■■ 5.51
SMARCA4P51532 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
SMARCA4P51532 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
SMARCA4P51532 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC49.42■■■■■ 5.5
SMARCA4P51532 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
SMARCA4P51532 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.38■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC49.38■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC49.35■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC49.34■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.34■■■■■ 5.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms