Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VEGFBP49765 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VEGFBP49765 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
VEGFBP49765 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VEGFBP49765 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VEGFBP49765 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VEGFBP49765 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
VEGFBP49765 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VEGFBP49765 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VEGFBP49765 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VEGFBP49765 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VEGFBP49765 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
VEGFBP49765 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
VEGFBP49765 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VEGFBP49765 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VEGFBP49765 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VEGFBP49765 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VEGFBP49765 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
VEGFBP49765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VEGFBP49765 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VEGFBP49765 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
VEGFBP49765 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VEGFBP49765 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
VEGFBP49765 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VEGFBP49765 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VEGFBP49765 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms