Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC48.98■■■■■ 5.43
NESP48681 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
NESP48681 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
NESP48681 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC48.94■■■■■ 5.43
NESP48681 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
NESP48681 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
NESP48681 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
NESP48681 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
NESP48681 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
NESP48681 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
NESP48681 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
NESP48681 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
NESP48681 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.8■■■■■ 5.4
NESP48681 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
NESP48681 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
NESP48681 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NESP48681 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NESP48681 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
NESP48681 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC48.72■■■■■ 5.39
NESP48681 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
NESP48681 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC48.7■■■■■ 5.39
NESP48681 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
NESP48681 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
NESP48681 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
NESP48681 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
NESP48681 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
NESP48681 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
NESP48681 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC48.64■■■■■ 5.38
NESP48681 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
NESP48681 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC48.63■■■■■ 5.38
NESP48681 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
NESP48681 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.61■■■■■ 5.37
NESP48681 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
NESP48681 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
NESP48681 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
NESP48681 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
NESP48681 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC48.54■■■■■ 5.36
NESP48681 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
NESP48681 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
NESP48681 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.36
NESP48681 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC48.5■■■■■ 5.35
NESP48681 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
NESP48681 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
NESP48681 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC48.45■■■■■ 5.35
NESP48681 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
NESP48681 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NESP48681 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NESP48681 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC48.42■■■■■ 5.34
NESP48681 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
NESP48681 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
NESP48681 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
NESP48681 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
NESP48681 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
NESP48681 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
NESP48681 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC48.36■■■■■ 5.33
NESP48681 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC48.36■■■■■ 5.33
NESP48681 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
NESP48681 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
NESP48681 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
NESP48681 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
NESP48681 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
NESP48681 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
NESP48681 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
NESP48681 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.28■■■■■ 5.32
NESP48681 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
NESP48681 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC48.26■■■■■ 5.32
NESP48681 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC48.26■■■■■ 5.32
NESP48681 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
NESP48681 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
NESP48681 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
NESP48681 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
NESP48681 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
NESP48681 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
NESP48681 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
NESP48681 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NESP48681 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NESP48681 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC48.16■■■■■ 5.3
NESP48681 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
NESP48681 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
NESP48681 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC48.14■■■■■ 5.3
NESP48681 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
NESP48681 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.29
NESP48681 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
NESP48681 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
NESP48681 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NESP48681 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NESP48681 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC48.08■■■■■ 5.29
NESP48681 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
NESP48681 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
NESP48681 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NESP48681 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NESP48681 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NESP48681 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
NESP48681 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
NESP48681 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
NESP48681 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
NESP48681 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
NESP48681 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NESP48681 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
NESP48681 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms