Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
NCAPD3P42695 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
NCAPD3P42695 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC50.06■■■■■ 5.6
NCAPD3P42695 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.06■■■■■ 5.6
NCAPD3P42695 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC50.05■■■■■ 5.6
NCAPD3P42695 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
NCAPD3P42695 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
NCAPD3P42695 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
NCAPD3P42695 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
NCAPD3P42695 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
NCAPD3P42695 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
NCAPD3P42695 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
NCAPD3P42695 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NCAPD3P42695 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NCAPD3P42695 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
NCAPD3P42695 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
NCAPD3P42695 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
NCAPD3P42695 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
NCAPD3P42695 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NCAPD3P42695 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NCAPD3P42695 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
NCAPD3P42695 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC49.76■■■■■ 5.56
NCAPD3P42695 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.75■■■■■ 5.55
NCAPD3P42695 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
NCAPD3P42695 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC49.69■■■■■ 5.55
NCAPD3P42695 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
NCAPD3P42695 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC49.69■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.54
NCAPD3P42695 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC49.63■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC49.63■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC49.59■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC49.58■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
NCAPD3P42695 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
NCAPD3P42695 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
NCAPD3P42695 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC49.55■■■■■ 5.52
NCAPD3P42695 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC49.52■■■■■ 5.52
NCAPD3P42695 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
NCAPD3P42695 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
NCAPD3P42695 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC49.49■■■■■ 5.51
NCAPD3P42695 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
NCAPD3P42695 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC49.46■■■■■ 5.51
NCAPD3P42695 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
NCAPD3P42695 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
NCAPD3P42695 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
NCAPD3P42695 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
NCAPD3P42695 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
NCAPD3P42695 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
NCAPD3P42695 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
NCAPD3P42695 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC49.35■■■■■ 5.49
NCAPD3P42695 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
NCAPD3P42695 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
NCAPD3P42695 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC49.33■■■■■ 5.49
NCAPD3P42695 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC49.3■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.3■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.26■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
NCAPD3P42695 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.47
NCAPD3P42695 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NCAPD3P42695 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NCAPD3P42695 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.22■■■■■ 5.47
NCAPD3P42695 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
NCAPD3P42695 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
NCAPD3P42695 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms