Protein–RNA interactions for Protein: P41218

MNDA, Myeloid cell nuclear differentiation antigen, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNDAP41218 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNDAP41218 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNDAP41218 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNDAP41218 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNDAP41218 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNDAP41218 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNDAP41218 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNDAP41218 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNDAP41218 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNDAP41218 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNDAP41218 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MNDAP41218 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MNDAP41218 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MNDAP41218 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MNDAP41218 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MNDAP41218 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MNDAP41218 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MNDAP41218 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MNDAP41218 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MNDAP41218 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MNDAP41218 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MNDAP41218 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MNDAP41218 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MNDAP41218 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MNDAP41218 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MNDAP41218 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MNDAP41218 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MNDAP41218 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MNDAP41218 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MNDAP41218 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MNDAP41218 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MNDAP41218 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MNDAP41218 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MNDAP41218 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MNDAP41218 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MNDAP41218 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MNDAP41218 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MNDAP41218 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MNDAP41218 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MNDAP41218 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MNDAP41218 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MNDAP41218 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MNDAP41218 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MNDAP41218 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MNDAP41218 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MNDAP41218 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MNDAP41218 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MNDAP41218 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MNDAP41218 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MNDAP41218 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MNDAP41218 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MNDAP41218 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MNDAP41218 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MNDAP41218 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MNDAP41218 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MNDAP41218 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MNDAP41218 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MNDAP41218 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MNDAP41218 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MNDAP41218 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MNDAP41218 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MNDAP41218 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MNDAP41218 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MNDAP41218 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MNDAP41218 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MNDAP41218 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MNDAP41218 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MNDAP41218 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MNDAP41218 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MNDAP41218 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MNDAP41218 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MNDAP41218 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MNDAP41218 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MNDAP41218 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MNDAP41218 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MNDAP41218 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MNDAP41218 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MNDAP41218 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MNDAP41218 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MNDAP41218 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MNDAP41218 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MNDAP41218 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MNDAP41218 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MNDAP41218 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MNDAP41218 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MNDAP41218 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MNDAP41218 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MNDAP41218 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MNDAP41218 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MNDAP41218 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MNDAP41218 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MNDAP41218 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MNDAP41218 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MNDAP41218 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MNDAP41218 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MNDAP41218 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MNDAP41218 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MNDAP41218 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MNDAP41218 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MNDAP41218 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms