Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCKBRP32239 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCKBRP32239 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCKBRP32239 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCKBRP32239 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCKBRP32239 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCKBRP32239 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCKBRP32239 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCKBRP32239 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCKBRP32239 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCKBRP32239 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCKBRP32239 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCKBRP32239 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCKBRP32239 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCKBRP32239 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCKBRP32239 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCKBRP32239 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCKBRP32239 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms