Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP29P30040 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP29P30040 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP29P30040 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP29P30040 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP29P30040 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP29P30040 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP29P30040 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP29P30040 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP29P30040 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP29P30040 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP29P30040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERP29P30040 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP29P30040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP29P30040 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP29P30040 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP29P30040 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP29P30040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP29P30040 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP29P30040 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP29P30040 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP29P30040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP29P30040 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP29P30040 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP29P30040 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP29P30040 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP29P30040 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP29P30040 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP29P30040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP29P30040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP29P30040 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP29P30040 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP29P30040 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP29P30040 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP29P30040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP29P30040 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP29P30040 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP29P30040 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP29P30040 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP29P30040 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP29P30040 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP29P30040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP29P30040 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP29P30040 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP29P30040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP29P30040 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP29P30040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP29P30040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP29P30040 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP29P30040 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP29P30040 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP29P30040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP29P30040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP29P30040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP29P30040 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP29P30040 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP29P30040 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP29P30040 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP29P30040 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP29P30040 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP29P30040 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP29P30040 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP29P30040 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP29P30040 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP29P30040 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP29P30040 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP29P30040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP29P30040 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP29P30040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP29P30040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP29P30040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP29P30040 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP29P30040 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP29P30040 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP29P30040 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP29P30040 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP29P30040 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP29P30040 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP29P30040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP29P30040 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP29P30040 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP29P30040 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP29P30040 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP29P30040 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP29P30040 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms