Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAX7P23759 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX7P23759 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX7P23759 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX7P23759 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAX7P23759 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX7P23759 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX7P23759 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX7P23759 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX7P23759 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX7P23759 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX7P23759 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX7P23759 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX7P23759 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX7P23759 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX7P23759 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX7P23759 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX7P23759 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX7P23759 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX7P23759 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX7P23759 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAX7P23759 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAX7P23759 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAX7P23759 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX7P23759 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX7P23759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX7P23759 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX7P23759 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX7P23759 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX7P23759 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX7P23759 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX7P23759 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX7P23759 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX7P23759 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX7P23759 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX7P23759 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX7P23759 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX7P23759 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX7P23759 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAX7P23759 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAX7P23759 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAX7P23759 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAX7P23759 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAX7P23759 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAX7P23759 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX7P23759 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX7P23759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX7P23759 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAX7P23759 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAX7P23759 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAX7P23759 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX7P23759 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX7P23759 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX7P23759 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAX7P23759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAX7P23759 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX7P23759 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX7P23759 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX7P23759 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX7P23759 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX7P23759 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX7P23759 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX7P23759 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX7P23759 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX7P23759 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX7P23759 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX7P23759 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX7P23759 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAX7P23759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAX7P23759 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAX7P23759 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX7P23759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX7P23759 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX7P23759 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX7P23759 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX7P23759 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX7P23759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX7P23759 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX7P23759 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX7P23759 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX7P23759 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX7P23759 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX7P23759 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX7P23759 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX7P23759 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX7P23759 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX7P23759 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX7P23759 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX7P23759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAX7P23759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAX7P23759 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAX7P23759 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAX7P23759 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms