Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME2P23368 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME2P23368 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME2P23368 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME2P23368 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME2P23368 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ME2P23368 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME2P23368 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME2P23368 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME2P23368 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME2P23368 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME2P23368 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME2P23368 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME2P23368 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME2P23368 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME2P23368 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ME2P23368 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME2P23368 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME2P23368 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME2P23368 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME2P23368 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME2P23368 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ME2P23368 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME2P23368 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME2P23368 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME2P23368 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME2P23368 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME2P23368 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME2P23368 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME2P23368 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME2P23368 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME2P23368 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME2P23368 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME2P23368 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME2P23368 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME2P23368 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME2P23368 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME2P23368 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME2P23368 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME2P23368 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME2P23368 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME2P23368 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME2P23368 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME2P23368 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME2P23368 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME2P23368 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME2P23368 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME2P23368 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME2P23368 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ME2P23368 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ME2P23368 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME2P23368 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME2P23368 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME2P23368 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME2P23368 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME2P23368 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME2P23368 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ME2P23368 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME2P23368 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME2P23368 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME2P23368 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME2P23368 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME2P23368 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME2P23368 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME2P23368 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME2P23368 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME2P23368 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ME2P23368 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME2P23368 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME2P23368 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME2P23368 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME2P23368 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME2P23368 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME2P23368 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME2P23368 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ME2P23368 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME2P23368 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME2P23368 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME2P23368 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME2P23368 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME2P23368 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME2P23368 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME2P23368 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME2P23368 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME2P23368 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME2P23368 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME2P23368 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME2P23368 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME2P23368 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME2P23368 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME2P23368 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME2P23368 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME2P23368 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME2P23368 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME2P23368 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME2P23368 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME2P23368 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME2P23368 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME2P23368 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME2P23368 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms