Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB3BP20337 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3BP20337 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3BP20337 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3BP20337 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3BP20337 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3BP20337 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms