Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBPP20226 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBPP20226 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBPP20226 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBPP20226 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBPP20226 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBPP20226 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBPP20226 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBPP20226 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBPP20226 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBPP20226 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBPP20226 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBPP20226 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBPP20226 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBPP20226 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBPP20226 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBPP20226 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBPP20226 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBPP20226 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBPP20226 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBPP20226 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBPP20226 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBPP20226 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBPP20226 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBPP20226 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBPP20226 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBPP20226 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBPP20226 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBPP20226 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBPP20226 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBPP20226 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBPP20226 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TBPP20226 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TBPP20226 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBPP20226 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBPP20226 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBPP20226 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBPP20226 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBPP20226 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBPP20226 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBPP20226 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBPP20226 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBPP20226 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBPP20226 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBPP20226 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBPP20226 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBPP20226 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBPP20226 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBPP20226 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBPP20226 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBPP20226 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBPP20226 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBPP20226 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBPP20226 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBPP20226 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBPP20226 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBPP20226 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBPP20226 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBPP20226 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBPP20226 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBPP20226 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBPP20226 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBPP20226 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBPP20226 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBPP20226 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBPP20226 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBPP20226 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBPP20226 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBPP20226 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBPP20226 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBPP20226 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBPP20226 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBPP20226 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBPP20226 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBPP20226 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBPP20226 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBPP20226 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBPP20226 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBPP20226 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBPP20226 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBPP20226 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBPP20226 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBPP20226 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBPP20226 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TBPP20226 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBPP20226 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBPP20226 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBPP20226 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBPP20226 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBPP20226 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBPP20226 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBPP20226 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBPP20226 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBPP20226 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBPP20226 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBPP20226 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBPP20226 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBPP20226 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBPP20226 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBPP20226 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms