Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRAP18433 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRAP18433 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRAP18433 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRAP18433 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRAP18433 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRAP18433 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRAP18433 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRAP18433 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRAP18433 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRAP18433 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRAP18433 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRAP18433 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRAP18433 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
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