Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DESP17661 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DESP17661 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DESP17661 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DESP17661 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DESP17661 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DESP17661 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DESP17661 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DESP17661 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DESP17661 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DESP17661 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DESP17661 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DESP17661 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DESP17661 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DESP17661 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DESP17661 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DESP17661 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DESP17661 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DESP17661 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DESP17661 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DESP17661 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DESP17661 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DESP17661 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DESP17661 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DESP17661 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DESP17661 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DESP17661 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DESP17661 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DESP17661 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DESP17661 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DESP17661 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DESP17661 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DESP17661 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DESP17661 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DESP17661 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DESP17661 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DESP17661 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DESP17661 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DESP17661 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DESP17661 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DESP17661 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DESP17661 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DESP17661 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DESP17661 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DESP17661 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DESP17661 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DESP17661 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DESP17661 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DESP17661 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DESP17661 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DESP17661 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DESP17661 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DESP17661 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DESP17661 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DESP17661 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DESP17661 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DESP17661 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DESP17661 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DESP17661 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DESP17661 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DESP17661 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DESP17661 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DESP17661 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DESP17661 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DESP17661 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DESP17661 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DESP17661 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DESP17661 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DESP17661 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DESP17661 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DESP17661 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DESP17661 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DESP17661 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DESP17661 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DESP17661 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DESP17661 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DESP17661 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DESP17661 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DESP17661 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DESP17661 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DESP17661 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DESP17661 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DESP17661 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DESP17661 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DESP17661 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DESP17661 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DESP17661 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DESP17661 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DESP17661 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DESP17661 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DESP17661 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DESP17661 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DESP17661 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DESP17661 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms