Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSPP15924 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSPP15924 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSPP15924 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSPP15924 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSPP15924 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DSPP15924 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSPP15924 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSPP15924 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSPP15924 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSPP15924 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DSPP15924 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSPP15924 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSPP15924 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DSPP15924 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSPP15924 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSPP15924 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSPP15924 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSPP15924 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSPP15924 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DSPP15924 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSPP15924 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSPP15924 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSPP15924 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DSPP15924 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSPP15924 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSPP15924 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSPP15924 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSPP15924 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSPP15924 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSPP15924 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSPP15924 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSPP15924 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSPP15924 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DSPP15924 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSPP15924 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSPP15924 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSPP15924 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSPP15924 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSPP15924 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSPP15924 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSPP15924 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSPP15924 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSPP15924 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSPP15924 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSPP15924 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSPP15924 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DSPP15924 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSPP15924 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSPP15924 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSPP15924 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSPP15924 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSPP15924 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSPP15924 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSPP15924 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSPP15924 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSPP15924 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSPP15924 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSPP15924 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSPP15924 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSPP15924 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSPP15924 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSPP15924 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSPP15924 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSPP15924 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DSPP15924 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSPP15924 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSPP15924 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSPP15924 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSPP15924 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSPP15924 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSPP15924 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSPP15924 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSPP15924 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSPP15924 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSPP15924 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSPP15924 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSPP15924 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSPP15924 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSPP15924 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSPP15924 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSPP15924 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSPP15924 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DSPP15924 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSPP15924 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSPP15924 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSPP15924 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSPP15924 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSPP15924 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DSPP15924 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSPP15924 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DSPP15924 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSPP15924 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSPP15924 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms