Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFB1P0C5Y9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFB1P0C5Y9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2AFB1P0C5Y9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFB1P0C5Y9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2AFB1P0C5Y9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2AFB1P0C5Y9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2AFB1P0C5Y9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFB1P0C5Y9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2AFB1P0C5Y9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFB1P0C5Y9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms