Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPIND1P05546 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPIND1P05546 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SERPIND1P05546 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPIND1P05546 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERPIND1P05546 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERPIND1P05546 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPIND1P05546 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms