Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG5P05408 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG5P05408 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG5P05408 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG5P05408 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG5P05408 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG5P05408 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG5P05408 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG5P05408 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG5P05408 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG5P05408 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG5P05408 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG5P05408 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG5P05408 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG5P05408 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG5P05408 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG5P05408 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG5P05408 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG5P05408 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG5P05408 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG5P05408 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG5P05408 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG5P05408 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG5P05408 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG5P05408 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG5P05408 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG5P05408 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG5P05408 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG5P05408 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG5P05408 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG5P05408 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG5P05408 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG5P05408 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG5P05408 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG5P05408 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG5P05408 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG5P05408 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG5P05408 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG5P05408 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG5P05408 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG5P05408 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG5P05408 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG5P05408 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCG5P05408 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCG5P05408 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCG5P05408 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG5P05408 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG5P05408 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG5P05408 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG5P05408 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG5P05408 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG5P05408 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG5P05408 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG5P05408 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG5P05408 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG5P05408 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG5P05408 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG5P05408 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG5P05408 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG5P05408 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG5P05408 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG5P05408 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG5P05408 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG5P05408 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG5P05408 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG5P05408 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG5P05408 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG5P05408 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG5P05408 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG5P05408 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG5P05408 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG5P05408 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG5P05408 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG5P05408 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG5P05408 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG5P05408 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG5P05408 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG5P05408 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG5P05408 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG5P05408 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG5P05408 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG5P05408 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG5P05408 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG5P05408 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG5P05408 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCG5P05408 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG5P05408 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG5P05408 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG5P05408 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG5P05408 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG5P05408 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG5P05408 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG5P05408 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG5P05408 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG5P05408 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG5P05408 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG5P05408 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG5P05408 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG5P05408 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG5P05408 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms