Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPRP00739 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPRP00739 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPRP00739 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPRP00739 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPRP00739 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPRP00739 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPRP00739 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPRP00739 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPRP00739 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPRP00739 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPRP00739 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPRP00739 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPRP00739 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPRP00739 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPRP00739 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPRP00739 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPRP00739 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPRP00739 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HPRP00739 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPRP00739 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HPRP00739 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPRP00739 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPRP00739 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPRP00739 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPRP00739 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPRP00739 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPRP00739 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPRP00739 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPRP00739 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPRP00739 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPRP00739 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPRP00739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPRP00739 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPRP00739 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPRP00739 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPRP00739 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPRP00739 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HPRP00739 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPRP00739 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPRP00739 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPRP00739 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPRP00739 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPRP00739 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPRP00739 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPRP00739 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPRP00739 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPRP00739 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPRP00739 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPRP00739 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPRP00739 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPRP00739 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPRP00739 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPRP00739 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPRP00739 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPRP00739 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPRP00739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPRP00739 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPRP00739 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPRP00739 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HPRP00739 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPRP00739 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPRP00739 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPRP00739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPRP00739 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPRP00739 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPRP00739 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPRP00739 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPRP00739 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPRP00739 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HPRP00739 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPRP00739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPRP00739 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPRP00739 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPRP00739 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPRP00739 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPRP00739 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPRP00739 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPRP00739 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPRP00739 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPRP00739 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPRP00739 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPRP00739 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPRP00739 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPRP00739 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPRP00739 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPRP00739 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPRP00739 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPRP00739 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPRP00739 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPRP00739 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPRP00739 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPRP00739 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPRP00739 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPRP00739 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPRP00739 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPRP00739 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms