Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBX6O95503 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX6O95503 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX6O95503 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX6O95503 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX6O95503 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX6O95503 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX6O95503 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX6O95503 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX6O95503 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX6O95503 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX6O95503 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX6O95503 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX6O95503 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX6O95503 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX6O95503 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX6O95503 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX6O95503 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX6O95503 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX6O95503 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX6O95503 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX6O95503 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX6O95503 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CBX6O95503 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX6O95503 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX6O95503 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX6O95503 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX6O95503 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX6O95503 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX6O95503 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX6O95503 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX6O95503 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX6O95503 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX6O95503 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX6O95503 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX6O95503 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX6O95503 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX6O95503 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX6O95503 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX6O95503 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX6O95503 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX6O95503 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX6O95503 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX6O95503 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX6O95503 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX6O95503 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX6O95503 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX6O95503 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX6O95503 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX6O95503 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX6O95503 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX6O95503 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX6O95503 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX6O95503 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX6O95503 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX6O95503 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX6O95503 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX6O95503 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX6O95503 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX6O95503 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX6O95503 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX6O95503 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX6O95503 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX6O95503 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX6O95503 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX6O95503 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX6O95503 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX6O95503 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX6O95503 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX6O95503 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX6O95503 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX6O95503 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX6O95503 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX6O95503 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX6O95503 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX6O95503 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX6O95503 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX6O95503 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CBX6O95503 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX6O95503 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX6O95503 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX6O95503 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX6O95503 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX6O95503 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX6O95503 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX6O95503 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX6O95503 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX6O95503 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX6O95503 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBX6O95503 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CBX6O95503 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms