Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSPG5O95196 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSPG5O95196 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPG5O95196 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSPG5O95196 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSPG5O95196 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CSPG5O95196 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSPG5O95196 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSPG5O95196 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPG5O95196 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSPG5O95196 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSPG5O95196 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPG5O95196 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPG5O95196 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPG5O95196 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSPG5O95196 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPG5O95196 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CSPG5O95196 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPG5O95196 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms