Protein–RNA interactions for Protein: O95167

NDUFA3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA3O95167 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA3O95167 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA3O95167 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA3O95167 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFA3O95167 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA3O95167 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA3O95167 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA3O95167 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms