Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4BO95155 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4BO95155 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE4BO95155 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE4BO95155 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE4BO95155 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4BO95155 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE4BO95155 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE4BO95155 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE4BO95155 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
UBE4BO95155 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBE4BO95155 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE4BO95155 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBE4BO95155 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4BO95155 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4BO95155 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms