Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
SOGA1O94964 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SOGA1O94964 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
SOGA1O94964 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
SOGA1O94964 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
SOGA1O94964 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SOGA1O94964 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SOGA1O94964 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
SOGA1O94964 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
SOGA1O94964 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
SOGA1O94964 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.82■■■■■ 5.09
SOGA1O94964 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
SOGA1O94964 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
SOGA1O94964 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SOGA1O94964 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SOGA1O94964 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SOGA1O94964 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
SOGA1O94964 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SOGA1O94964 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SOGA1O94964 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
SOGA1O94964 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC46.67■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.66■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
SOGA1O94964 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
SOGA1O94964 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SOGA1O94964 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
SOGA1O94964 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
SOGA1O94964 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SOGA1O94964 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
SOGA1O94964 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
SOGA1O94964 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
SOGA1O94964 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.54■■■■■ 5.04
SOGA1O94964 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SOGA1O94964 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
SOGA1O94964 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
SOGA1O94964 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
SOGA1O94964 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
SOGA1O94964 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
SOGA1O94964 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SOGA1O94964 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
SOGA1O94964 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
SOGA1O94964 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SOGA1O94964 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SOGA1O94964 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC46.28■■■■■ 5
SOGA1O94964 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
SOGA1O94964 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SOGA1O94964 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SOGA1O94964 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SOGA1O94964 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SOGA1O94964 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
SOGA1O94964 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
SOGA1O94964 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC46.07■■■■■ 4.97
SOGA1O94964 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC46.04■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.01■■■■■ 4.96
SOGA1O94964 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
SOGA1O94964 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SOGA1O94964 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SOGA1O94964 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
SOGA1O94964 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
SOGA1O94964 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.94■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms