Protein–RNA interactions for Protein: O94823

ATP10B, Probable phospholipid-transporting ATPase VB, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10BO94823 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ATP10BO94823 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ATP10BO94823 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ATP10BO94823 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ATP10BO94823 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ATP10BO94823 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ATP10BO94823 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ATP10BO94823 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ATP10BO94823 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ATP10BO94823 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ATP10BO94823 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ATP10BO94823 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ATP10BO94823 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ATP10BO94823 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.04■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ATP10BO94823 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43■■■■■ 4.47
ATP10BO94823 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ATP10BO94823 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ATP10BO94823 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ATP10BO94823 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
ATP10BO94823 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
ATP10BO94823 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ATP10BO94823 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ATP10BO94823 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ATP10BO94823 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ATP10BO94823 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ATP10BO94823 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ATP10BO94823 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
ATP10BO94823 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
ATP10BO94823 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
ATP10BO94823 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ATP10BO94823 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ATP10BO94823 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ATP10BO94823 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ATP10BO94823 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ATP10BO94823 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms