Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK1BO75841 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPK1BO75841 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK1BO75841 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK1BO75841 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK1BO75841 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK1BO75841 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms