Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3AO75631 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3AO75631 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK3AO75631 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPK3AO75631 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3AO75631 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3AO75631 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPK3AO75631 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms