Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL41O60662 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL41O60662 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL41O60662 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL41O60662 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL41O60662 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL41O60662 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL41O60662 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms