Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GFRA3O60609 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GFRA3O60609 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GFRA3O60609 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GFRA3O60609 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GFRA3O60609 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GFRA3O60609 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GFRA3O60609 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GFRA3O60609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA3O60609 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA3O60609 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GFRA3O60609 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GFRA3O60609 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA3O60609 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GFRA3O60609 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GFRA3O60609 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GFRA3O60609 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GFRA3O60609 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRA3O60609 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms