Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCP110O43303 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCP110O43303 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCP110O43303 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCP110O43303 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCP110O43303 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCP110O43303 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCP110O43303 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCP110O43303 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCP110O43303 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCP110O43303 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCP110O43303 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCP110O43303 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCP110O43303 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCP110O43303 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCP110O43303 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCP110O43303 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCP110O43303 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCP110O43303 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCP110O43303 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCP110O43303 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCP110O43303 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCP110O43303 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCP110O43303 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCP110O43303 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCP110O43303 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCP110O43303 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCP110O43303 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCP110O43303 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCP110O43303 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCP110O43303 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCP110O43303 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCP110O43303 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCP110O43303 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCP110O43303 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCP110O43303 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCP110O43303 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCP110O43303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCP110O43303 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCP110O43303 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCP110O43303 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCP110O43303 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCP110O43303 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCP110O43303 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCP110O43303 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCP110O43303 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCP110O43303 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCP110O43303 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCP110O43303 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCP110O43303 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCP110O43303 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCP110O43303 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCP110O43303 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCP110O43303 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCP110O43303 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCP110O43303 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCP110O43303 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCP110O43303 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCP110O43303 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCP110O43303 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCP110O43303 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCP110O43303 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCP110O43303 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCP110O43303 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCP110O43303 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCP110O43303 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCP110O43303 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCP110O43303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCP110O43303 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCP110O43303 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCP110O43303 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCP110O43303 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCP110O43303 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCP110O43303 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCP110O43303 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCP110O43303 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCP110O43303 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCP110O43303 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCP110O43303 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCP110O43303 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCP110O43303 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCP110O43303 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCP110O43303 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCP110O43303 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCP110O43303 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCP110O43303 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCP110O43303 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCP110O43303 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCP110O43303 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCP110O43303 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCP110O43303 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCP110O43303 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCP110O43303 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCP110O43303 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCP110O43303 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCP110O43303 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCP110O43303 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCP110O43303 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCP110O43303 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCP110O43303 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms