Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ST8SIA3O43173 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST8SIA3O43173 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ST8SIA3O43173 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ST8SIA3O43173 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ST8SIA3O43173 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ST8SIA3O43173 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST8SIA3O43173 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ST8SIA3O43173 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ST8SIA3O43173 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ST8SIA3O43173 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ST8SIA3O43173 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ST8SIA3O43173 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ST8SIA3O43173 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms