Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SYNJ2O15056 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
SYNJ2O15056 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
SYNJ2O15056 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
SYNJ2O15056 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SYNJ2O15056 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
SYNJ2O15056 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
SYNJ2O15056 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SYNJ2O15056 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SYNJ2O15056 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
SYNJ2O15056 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
SYNJ2O15056 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SYNJ2O15056 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
SYNJ2O15056 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
SYNJ2O15056 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SYNJ2O15056 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SYNJ2O15056 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
SYNJ2O15056 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.42■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
SYNJ2O15056 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
SYNJ2O15056 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
SYNJ2O15056 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SYNJ2O15056 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
SYNJ2O15056 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SYNJ2O15056 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
SYNJ2O15056 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SYNJ2O15056 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
SYNJ2O15056 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
SYNJ2O15056 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
SYNJ2O15056 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SYNJ2O15056 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SYNJ2O15056 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SYNJ2O15056 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
SYNJ2O15056 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SYNJ2O15056 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SYNJ2O15056 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SYNJ2O15056 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
SYNJ2O15056 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms