Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
CUX2O14529 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
CUX2O14529 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
CUX2O14529 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
CUX2O14529 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CUX2O14529 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
CUX2O14529 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CUX2O14529 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CUX2O14529 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
CUX2O14529 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
CUX2O14529 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
CUX2O14529 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CUX2O14529 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CUX2O14529 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
CUX2O14529 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
CUX2O14529 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
CUX2O14529 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
CUX2O14529 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC48.34■■■■■ 5.33
CUX2O14529 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
CUX2O14529 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
CUX2O14529 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
CUX2O14529 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CUX2O14529 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CUX2O14529 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
CUX2O14529 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC48.27■■■■■ 5.32
CUX2O14529 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.25■■■■■ 5.31
CUX2O14529 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
CUX2O14529 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC48.25■■■■■ 5.31
CUX2O14529 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
CUX2O14529 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CUX2O14529 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CUX2O14529 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
CUX2O14529 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.31
CUX2O14529 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
CUX2O14529 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CUX2O14529 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC48.17■■■■■ 5.3
CUX2O14529 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC48.16■■■■■ 5.3
CUX2O14529 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
CUX2O14529 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CUX2O14529 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
CUX2O14529 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CUX2O14529 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CUX2O14529 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC48.12■■■■■ 5.29
CUX2O14529 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CUX2O14529 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CUX2O14529 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
CUX2O14529 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CUX2O14529 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
CUX2O14529 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
CUX2O14529 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.05■■■■■ 5.28
CUX2O14529 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CUX2O14529 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
CUX2O14529 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
CUX2O14529 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CUX2O14529 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CUX2O14529 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CUX2O14529 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CUX2O14529 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CUX2O14529 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
CUX2O14529 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
CUX2O14529 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
CUX2O14529 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
CUX2O14529 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
CUX2O14529 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
CUX2O14529 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
CUX2O14529 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
CUX2O14529 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CUX2O14529 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC47.87■■■■■ 5.25
CUX2O14529 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CUX2O14529 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CUX2O14529 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
CUX2O14529 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CUX2O14529 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC47.82■■■■■ 5.25
CUX2O14529 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
CUX2O14529 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
CUX2O14529 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
CUX2O14529 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC47.75■■■■■ 5.24
CUX2O14529 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
CUX2O14529 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
CUX2O14529 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC47.71■■■■■ 5.23
CUX2O14529 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
CUX2O14529 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
CUX2O14529 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.21
CUX2O14529 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
CUX2O14529 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CUX2O14529 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CUX2O14529 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CUX2O14529 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CUX2O14529 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CUX2O14529 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
CUX2O14529 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CUX2O14529 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
CUX2O14529 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CUX2O14529 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
CUX2O14529 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
CUX2O14529 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC47.51■■■■■ 5.2
CUX2O14529 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
CUX2O14529 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
CUX2O14529 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
CUX2O14529 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms