Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 GRK6-204ENST00000502598 557 ntTSL 418.84■□□□□ 0.616e-13■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 GRK6-208ENST00000511244 555 ntTSL 418.55■□□□□ 0.566e-13■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 GRK6-205ENST00000506296 955 ntTSL 517.84■□□□□ 0.456e-13■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 COPS3-207ENST00000477299 656 ntTSL 516.69■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-210ENST00000492672 809 ntTSL 416.69■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-214ENST00000577246 639 ntTSL 213.05□□□□□ -0.321e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-218ENST00000584216 876 ntTSL 313.05□□□□□ -0.321e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-215ENST00000578317 1625 ntTSL 28.48□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-202ENST00000417352 1009 ntTSL 56.95□□□□□ -1.31e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 COPS3-213ENST00000577210 752 ntTSL 33.36□□□□□ -1.871e-11■■■■■ 78.4
DDX3XO00571 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.232e-69■■■■■ 78.1
DDX3XO00571 AC007388.1-202ENST00000443038 522 ntTSL 421.5■■□□□ 1.031e-13■■■■■ 78
DDX3XO00571 AC007388.1-203ENST00000422128 596 ntTSL 420.48■□□□□ 0.871e-13■■■■■ 78
DDX3XO00571 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.151e-13■■■■■ 78
DDX3XO00571 AC007388.1-205ENST00000445520 499 ntTSL 214.46□□□□□ -0.091e-13■■■■■ 78
DDX3XO00571 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.071e-13■■■■■ 78
DDX3XO00571 TMEM147-206ENST00000595180 546 ntTSL 219.42■□□□□ 0.75e-13■■■■■ 77.9
DDX3XO00571 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 225.44■■□□□ 1.669e-14■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-224ENST00000600718 1993 ntTSL 518.96■□□□□ 0.635e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-219ENST00000599575 810 ntTSL 517.32■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-211ENST00000595945 823 ntTSL 315.76■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-209ENST00000595803 773 ntTSL 513.91□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 SHKBP1-220ENST00000599716 572 ntTSL 28.56□□□□□ -1.045e-8■■■■■ 77.1
DDX3XO00571 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.32■□□□□ 0.683e-48■■■■■ 77
DDX3XO00571 RNF6-204ENST00000468480 1105 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.431e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 APIP-202ENST00000527830 1042 ntTSL 217.71■□□□□ 0.431e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 AAGAB-206ENST00000561229 529 ntTSL 414.84□□□□□ -0.031e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 AAGAB-204ENST00000558725 810 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.271e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.061e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-15■■■■■ 77
DDX3XO00571 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 76.9
DDX3XO00571 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.885e-12■■■■■ 76.7
DDX3XO00571 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.185e-12■■■■■ 76.7
DDX3XO00571 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-12■■■■■ 76.7
DDX3XO00571 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-12■■■■■ 76.7
DDX3XO00571 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.094e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-211ENST00000492185 1786 ntTSL 221.66■■□□□ 1.064e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-208ENST00000481121 1543 ntTSL 221.46■■□□□ 1.034e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-210ENST00000491139 582 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.844e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-212ENST00000492539 583 ntTSL 319.83■□□□□ 0.774e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-209ENST00000488426 1855 ntTSL 513.64□□□□□ -0.234e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-205ENST00000441998 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.32□□□□□ -0.64e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 NELFE-213ENST00000494956 568 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-20■■■■■ 76.5
DDX3XO00571 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.918e-9■■■■■ 76.4
DDX3XO00571 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-9■■■■■ 76.4
DDX3XO00571 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.393e-7■■■■■ 76.1
DDX3XO00571 CEP76-209ENST00000590143 2380 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 76
DDX3XO00571 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 76
DDX3XO00571 CEP76-204ENST00000586887 897 ntTSL 218.08■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 76
DDX3XO00571 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 76
DDX3XO00571 CEP76-206ENST00000587929 787 ntTSL 415.73■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 76
DDX3XO00571 CEP76-212ENST00000593250 3309 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 76
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DDX3XO00571 HYAL2-206ENST00000428028 571 ntTSL 317.95■□□□□ 0.466e-50■■■■■ 75.9
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DDX3XO00571 PRUNE1-201ENST00000271620 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.527e-9■■■■■ 75.8
DDX3XO00571 PRUNE1-207ENST00000450884 825 ntTSL 511.72□□□□□ -0.537e-9■■■■■ 75.8
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DDX3XO00571 PRUNE1-203ENST00000368935 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.677e-9■■■■■ 75.8
DDX3XO00571 PRUNE1-204ENST00000368936 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.737e-9■■■■■ 75.8
DDX3XO00571 DAG1-206ENST00000430636 397 ntTSL 421.63■■□□□ 1.052e-64■■■■■ 75.6
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DDX3XO00571 DAG1-203ENST00000419218 562 ntTSL 219.99■□□□□ 0.792e-64■■■■■ 75.6
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DDX3XO00571 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.65e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-213ENST00000466701 364 ntTSL 418.69■□□□□ 0.582e-26■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.555e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-210ENST00000452317 547 ntTSL 418.11■□□□□ 0.492e-26■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.485e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.475e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-205ENST00000428779 841 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-26■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-208ENST00000435508 624 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-26■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.365e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-217ENST00000496474 539 ntTSL 416.37■□□□□ 0.212e-64■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-204ENST00000421560 579 ntTSL 416.29■□□□□ 0.24e-19■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-212ENST00000461987 372 ntTSL 316■□□□□ 0.153e-26■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-207ENST00000431960 549 ntTSL 412.81□□□□□ -0.365e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.395e-17■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 DAG1-214ENST00000469139 561 ntTSL 410.98□□□□□ -0.657e-26■■■■■ 75.6
DDX3XO00571 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.673e-28■■■■■ 75.1
DDX3XO00571 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-28■■■■■ 75.1
DDX3XO00571 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-28■■■■■ 75.1
DDX3XO00571 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.43e-28■■■■■ 75.1
DDX3XO00571 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.223e-28■■■■■ 75.1
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