Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAD1O00515 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAD1O00515 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAD1O00515 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAD1O00515 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAD1O00515 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LAD1O00515 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAD1O00515 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAD1O00515 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAD1O00515 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAD1O00515 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAD1O00515 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAD1O00515 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAD1O00515 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAD1O00515 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAD1O00515 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAD1O00515 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LAD1O00515 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAD1O00515 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAD1O00515 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAD1O00515 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAD1O00515 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAD1O00515 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAD1O00515 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAD1O00515 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAD1O00515 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAD1O00515 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAD1O00515 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAD1O00515 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAD1O00515 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAD1O00515 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAD1O00515 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAD1O00515 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAD1O00515 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAD1O00515 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAD1O00515 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LAD1O00515 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LAD1O00515 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAD1O00515 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAD1O00515 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAD1O00515 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAD1O00515 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAD1O00515 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAD1O00515 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAD1O00515 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAD1O00515 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LAD1O00515 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAD1O00515 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAD1O00515 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAD1O00515 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LAD1O00515 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LAD1O00515 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LAD1O00515 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAD1O00515 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAD1O00515 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAD1O00515 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAD1O00515 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAD1O00515 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAD1O00515 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAD1O00515 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAD1O00515 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAD1O00515 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAD1O00515 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAD1O00515 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LAD1O00515 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAD1O00515 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAD1O00515 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAD1O00515 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAD1O00515 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAD1O00515 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LAD1O00515 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAD1O00515 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAD1O00515 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAD1O00515 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAD1O00515 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAD1O00515 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAD1O00515 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAD1O00515 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAD1O00515 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LAD1O00515 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LAD1O00515 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LAD1O00515 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LAD1O00515 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LAD1O00515 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAD1O00515 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAD1O00515 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAD1O00515 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LAD1O00515 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAD1O00515 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LAD1O00515 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LAD1O00515 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LAD1O00515 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAD1O00515 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LAD1O00515 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LAD1O00515 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LAD1O00515 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LAD1O00515 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LAD1O00515 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAD1O00515 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAD1O00515 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.6 ms