Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP1O00294 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP1O00294 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP1O00294 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TULP1O00294 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP1O00294 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP1O00294 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP1O00294 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP1O00294 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP1O00294 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP1O00294 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP1O00294 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP1O00294 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP1O00294 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP1O00294 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP1O00294 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP1O00294 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP1O00294 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP1O00294 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP1O00294 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP1O00294 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP1O00294 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP1O00294 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP1O00294 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP1O00294 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP1O00294 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP1O00294 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP1O00294 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP1O00294 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP1O00294 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TULP1O00294 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP1O00294 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP1O00294 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP1O00294 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP1O00294 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP1O00294 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP1O00294 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP1O00294 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP1O00294 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TULP1O00294 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP1O00294 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP1O00294 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP1O00294 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP1O00294 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP1O00294 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP1O00294 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP1O00294 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TULP1O00294 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TULP1O00294 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TULP1O00294 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP1O00294 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP1O00294 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP1O00294 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP1O00294 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP1O00294 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP1O00294 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP1O00294 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP1O00294 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP1O00294 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP1O00294 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP1O00294 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP1O00294 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP1O00294 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP1O00294 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP1O00294 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP1O00294 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP1O00294 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP1O00294 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP1O00294 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP1O00294 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP1O00294 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP1O00294 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP1O00294 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP1O00294 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP1O00294 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP1O00294 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP1O00294 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP1O00294 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP1O00294 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP1O00294 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP1O00294 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP1O00294 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TULP1O00294 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP1O00294 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP1O00294 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP1O00294 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP1O00294 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP1O00294 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP1O00294 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP1O00294 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP1O00294 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP1O00294 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP1O00294 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms