Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms