Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OVOL3O00110 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OVOL3O00110 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OVOL3O00110 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OVOL3O00110 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OVOL3O00110 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OVOL3O00110 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OVOL3O00110 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OVOL3O00110 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OVOL3O00110 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OVOL3O00110 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OVOL3O00110 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OVOL3O00110 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OVOL3O00110 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OVOL3O00110 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms