Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms