Protein–RNA interactions for Protein: H3BR10

SMLR1, Small leucine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMLR1H3BR10 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMLR1H3BR10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMLR1H3BR10 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMLR1H3BR10 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMLR1H3BR10 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMLR1H3BR10 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMLR1H3BR10 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMLR1H3BR10 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms