Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERVV-2B6SEH9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERVV-2B6SEH9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERVV-2B6SEH9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERVV-2B6SEH9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERVV-2B6SEH9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERVV-2B6SEH9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERVV-2B6SEH9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERVV-2B6SEH9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERVV-2B6SEH9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERVV-2B6SEH9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERVV-2B6SEH9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERVV-2B6SEH9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERVV-2B6SEH9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERVV-2B6SEH9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERVV-2B6SEH9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERVV-2B6SEH9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERVV-2B6SEH9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERVV-2B6SEH9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
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