Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A6NNZ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
A6NNZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A6NNZ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A6NNZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A6NNZ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A6NNZ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A6NNZ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A6NNZ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A6NNZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A6NNZ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A6NNZ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A6NNZ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A6NNZ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A6NNZ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A6NNZ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A6NNZ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A6NNZ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A6NNZ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A6NNZ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A6NNZ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A6NNZ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A6NNZ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A6NNZ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A6NNZ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A6NNZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A6NNZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A6NNZ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A6NNZ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A6NNZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A6NNZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A6NNZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A6NNZ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A6NNZ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A6NNZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A6NNZ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A6NNZ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A6NNZ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A6NNZ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NNZ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NNZ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NNZ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A6NNZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A6NNZ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A6NNZ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NNZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NNZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A6NNZ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A6NNZ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
A6NNZ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NNZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NNZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NNZ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NNZ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
A6NNZ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A6NNZ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A6NNZ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A6NNZ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A6NNZ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A6NNZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A6NNZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NNZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NNZ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NNZ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NNZ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A6NNZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NNZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NNZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NNZ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NNZ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A6NNZ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A6NNZ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A6NNZ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NNZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NNZ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NNZ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NNZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A6NNZ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NNZ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NNZ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NNZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A6NNZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A6NNZ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A6NNZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A6NNZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A6NNZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A6NNZ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A6NNZ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A6NNZ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A6NNZ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A6NNZ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A6NNZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A6NNZ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A6NNZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms