Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC8

Putative TAF11-like protein ENSP00000332601, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NLC8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NLC8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NLC8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NLC8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NLC8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NLC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NLC8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NLC8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NLC8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NLC8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NLC8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NLC8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A6NLC8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A6NLC8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6NLC8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NLC8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NLC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NLC8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A6NLC8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A6NLC8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6NLC8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A6NLC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6NLC8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6NLC8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A6NLC8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NLC8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NLC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6NLC8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NLC8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NLC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NLC8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NLC8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NLC8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NLC8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NLC8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NLC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NLC8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NLC8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NLC8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NLC8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NLC8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NLC8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NLC8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NLC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NLC8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NLC8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NLC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NLC8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NLC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NLC8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NLC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NLC8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NLC8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NLC8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NLC8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NLC8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NLC8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NLC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NLC8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NLC8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NLC8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NLC8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NLC8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NLC8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NLC8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NLC8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NLC8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NLC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NLC8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NLC8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NLC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NLC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NLC8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NLC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NLC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NLC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NLC8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NLC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NLC8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NLC8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NLC8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NLC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NLC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NLC8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NLC8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NLC8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NLC8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NLC8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NLC8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NLC8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NLC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NLC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NLC8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms