Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PICALM-212ENST00000529760 1153 ntTSL 54.09□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 41.9
SF3B1O75533 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 41.9
SF3B1O75533 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 41.9
SF3B1O75533 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 41.9
SF3B1O75533 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 33.09□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 41.9
SF3B1O75533 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.253e-11■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 AP003900.1-202ENST00000616952 225 ntTSL 311.51□□□□□ -0.573e-11■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 SLC4A2-218ENST00000494125 782 ntTSL 226.58■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 SLC4A2-205ENST00000463414 793 ntTSL 318.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 SLC4A2-213ENST00000483786 571 ntTSL 418.47■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 SLC4A2-216ENST00000490898 702 ntTSL 317.23■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 SLC4A2-212ENST00000482950 500 ntTSL 415.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 PABPC4-205ENST00000421687 1663 ntTSL 515.07■□□□□ 01e-9■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 ANXA2-218ENST00000559176 744 ntTSL 53.33□□□□□ -1.881e-9■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 TXNRD2-219ENST00000634471 748 ntTSL 318.47■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 TXNRD2-213ENST00000487165 2020 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-207ENST00000494655 793 ntTSL 222.67■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-213ENST00000605875 380 ntTSL 520.02■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 219.89■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 319.89■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-212ENST00000605358 402 ntTSL 519.71■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-210ENST00000604181 550 ntTSL 418.65■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-209ENST00000604164 399 ntTSL 312.64□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 311.78□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 CCDC12-204ENST00000460035 572 ntTSL 211.73□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 41.8
SF3B1O75533 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 SSX2IP-207ENST00000481102 2457 ntTSL 520.36■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 SSX2IP-206ENST00000476905 2272 ntTSL 29.77□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 PHF19-213ENST00000487555 1092 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 PHF19-206ENST00000453868 565 ntTSL 511.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 41.7
SF3B1O75533 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.622e-11■■■■■ 41.6
SF3B1O75533 TRIM41-208ENST00000515499 914 ntTSL 322.52■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 41.6
SF3B1O75533 TAF15-212ENST00000604879 808 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 41.6
SF3B1O75533 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 56.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 41.6
SF3B1O75533 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 512.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 41.6
SF3B1O75533 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-10■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.666e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-213ENST00000481030 790 ntTSL 312.64□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 PTBP1-205ENST00000585535 314 ntTSL 312.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 ICAM5-203ENST00000586480 2599 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 41.5
SF3B1O75533 LZTR1-202ENST00000414985 872 ntTSL 524.21■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 LZTR1-212ENST00000480895 539 ntTSL 415.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 BRD4-209ENST00000601071 430 ntTSL 55.73□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 USP42-202ENST00000404008 1380 ntTSL 231.64■■■□□ 2.662e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-203ENST00000553359 797 ntTSL 230.82■■■□□ 2.522e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DUS1L-211ENST00000578907 1084 ntTSL 330.35■■■□□ 2.452e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DUS1L-215ENST00000582529 1212 ntTSL 528.96■■■□□ 2.232e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DUS1L-207ENST00000578176 937 ntTSL 528.36■■■□□ 2.132e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DHRS11-212ENST00000612538 756 ntTSL 527.32■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-218ENST00000556868 1067 ntTSL 225.58■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 525.43■■□□□ 1.662e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SNX3-203ENST00000368979 1537 ntTSL 225.18■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 AMFR-211ENST00000568657 539 ntTSL 424.94■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 STXBP2-212ENST00000597467 821 ntTSL 324.69■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 AMFR-206ENST00000565445 803 ntTSL 523.26■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 GLI4-209ENST00000522479 435 ntTSL 323.16■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 STXBP2-218ENST00000599905 589 ntTSL 422.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 TCF25-208ENST00000563032 274 ntTSL 222.41■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 321.98■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 BIRC5-210ENST00000592115 1141 ntTSL 1 (best)21.94■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-216ENST00000556715 1025 ntTSL 321.92■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-219ENST00000556873 569 ntTSL 421.73■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 421.3■■□□□ 12e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-206ENST00000554224 1124 ntTSL 321.01■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 SLC25A29-205ENST00000554060 674 ntTSL 220.99■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.96■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 MED10-203ENST00000504058 648 ntTSL 220.96■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 220.93■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 AC008763.2-202ENST00000599243 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.93■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 C1RL-203ENST00000534950 582 ntTSL 320.31■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 NUP50-207ENST00000424634 579 ntTSL 320.27■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 DHRS11-213ENST00000615432 926 ntTSL 320.21■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 BIRC5-208ENST00000590925 648 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 219.77■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 41.4
SF3B1O75533 NUP50-218ENST00000493456 478 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 41.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3538.8 ms