Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYY5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYY5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYY5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYY5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYY5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYY5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYY5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYY5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYY5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms