Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED16Q9Y2X0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms